第十二章 多糖分子模拟

    因此，这种营养物质的首要条件，便是要小。

    方舟换回了办公常用的文到死系统，开始在知网上和国外的学术论坛上大量搜索有关糖类物质的相关资料。

    但这也是徒劳，早在前往西贝大学之前，方舟就看过了大量的营养学资料，如果能有对应的物质，那方舟一定会第一时间知道并加以实验。

    现实世界没有，只能自己造了。

    这又是一个全新的领域，生物学和化工学交织的学术领域。

    就如同化学专业的研究生制备化合物时常用的方法一样，方舟也开始和化学生一样来进行多糖物质的设计。

    正常的化合物合成路线是这样的：先确定目标化合物的结构，再设计合成路线，合成目标化合物，最后对样品进行结构测定试验其性质或功能。

    路线的核心，必然是确定目标化合物的结构。

    对于方舟来说，目标化合物并不存在，也无从考证，一切都需要方舟重新开始进行设计。

    从原始的单糖类物质的葡萄糖开始，分子式C6H12O6，结构为最基本的五个羟基，一个醛基，具有多元醇和醛开始进行设计。

    逐渐增加数量，设计各种角度的连接方式。

    以旋光性、溶解度、甜度等为评价函数，对每一个合成的大分子进行测定。

    以某些已经存在的大分子糖类物质测定数据作为参考，回去自己房间的魏莱似乎洗完澡之后就进入了梦乡，并没有来打扰方舟。

    方舟就这样在电脑前做了一整夜。

    先是在利用强大的计算机能力，在原有的HyperChem化学分子结构计算软件基础上进行修改，使其具有快速自动拼接的功能。

    这是一款以分子力学、分子动力学和半经验分子轨道方法和密度泛函理论为理论依据设计的外国软件，对于进行蛋白质分析的化学生来说颇为好用，但是用来分析糖类物质时，功能就有些别扭。

    后半夜，方舟面前的这台笔记本开始了疯狂的工作状态，一晚上仅从单糖推导至三糖，就生成了上万组数据。

    方舟的将这些数据拉入建模软件进行分子性质的计算分析、单点能、几何优化、分子轨道分析，蒙特卡罗和分子力学计算模拟。

    虽然是一台全球最高配的笔记本电脑，但也架不住方舟如此的使用。

    磅礴的风扇声回响在整个房间里，带着充足的热量，使夜晚的房间都带着几分温暖。

    所幸，虽然电量消耗的飞快，但是电源也是特制的电源，勉强能够供应芯片的计算量。

    陷入工作状态的方舟对着风扇声充耳不闻，完全把电脑当成了一台永远耕不坏的地，尽情的蹂躏着。

    但很可惜，直到天亮的时候，模拟出来的上万组分子结构都没有能够满足方舟的功能要求。

    方舟正欲接着加入更多糖分子结构的计算，但是电脑叮了一声，屏幕很快陷入了黑暗之中。chaptere